Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms