Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04214 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04214 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04214 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04214 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04214 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04214 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04214 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04214 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms