Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04213 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04213 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P04213 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04213 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms