Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lamc1P02468 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms