Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01810 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01810 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01810 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01810 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms