Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01648 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01648 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01648 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01648 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01648 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01648 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms