Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms