Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Ccl20O89093 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl20O89093 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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