Protein–RNA interactions for Protein: O89091

Klf10, Krueppel-like factor 10, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf10O89091 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf10O89091 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf10O89091 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf10O89091 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms