Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CopeO89079 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopeO89079 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopeO89079 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopeO89079 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopeO89079 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopeO89079 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopeO89079 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopeO89079 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms