Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms