Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcn2O88968 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcn2O88968 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms