Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda1O88958 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms