Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ltb4rO88855 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ltb4rO88855 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms