Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms