Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx3O70492 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms