Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tspan6O70401 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan6O70401 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tspan6O70401 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan6O70401 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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