Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sigmar1O55242 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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