Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HcrtO55241 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms