Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb2O55203 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ldb2O55203 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldb2O55203 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms