Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Supt5hO55201 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms