Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nthl1O35980 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nthl1O35980 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms