Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppfibp2O35711 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp2O35711 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms