Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn6O35646 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms