Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Clk4O35493 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk4O35493 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms