Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms