Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xbp1O35426 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms