Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms