Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ptpn9O35239 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn9O35239 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms