Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms