Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps1O08983 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps1O08983 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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