Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eftud2O08810 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eftud2O08810 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms