Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22bO08547 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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