Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna5O08543 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms