Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MsmbO08540 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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