Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms