Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smim18J3QNP2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms