Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm17577J3QNF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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