Protein–RNA interactions for Protein: J3QK78

Gm3139, Predicted gene 3139, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3139J3QK78 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3139J3QK78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3139J3QK78 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms