Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem200cJ3QK46 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem200cJ3QK46 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms