Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21818J3KMS6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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