Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfip1G5E8V9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfip1G5E8V9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms