Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccl26F8VQM2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms