Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8444F6XS56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms