Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10477F6SW83 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10477F6SW83 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms