Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7945F6QI24 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7945F6QI24 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms