Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc6F2Z461 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms