Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa27F2Z403 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms