Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms