Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtproE9Q612 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms